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對于唇腭裂的原因來講，引起發(fā)育和綜合障礙的確切原因或發(fā)病機(jī)理現(xiàn)在尚未完全明了。大概通過實(shí)驗(yàn)和流行病學(xué)的觀察以及調(diào)查結(jié)果，可分為多種因素影響的，而非單一因素所致。一般包括遺傳因素和環(huán)境因素兩個(gè)方面，并與營養(yǎng)、遺傳、環(huán)境、內(nèi)分泌等因素有關(guān)。
遺傳原因，唇腭裂的患者發(fā)現(xiàn)其旁系親屬以及直系親屬中也有類似的畸形發(fā)生