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幽門螺桿菌檢查包括侵入性檢查方法和非侵入性檢查方法。侵入性檢查方法主要是在內鏡下，采取活檢組織進行快速尿素酶試驗，它的價格在50元左右，相對較便宜。
另外，非侵入性的方法包括碳13呼氣試驗、碳14呼氣試驗以及幽門螺桿菌抗體檢查，碳14呼氣試驗價格在90-100元之間，碳13尿素呼氣試驗價格在200-250元之間，因為碳13不具有放射性，所以使用的范圍更廣，價格也相對更貴。
除此以外，幽門螺桿菌抗體檢查也可以確定是否存在幽門螺桿菌感染，它的價格大概在100元左右。