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黃連素不是抗生素，黃連素在藥物分類上屬于非甾體消炎藥，但其有一定的抗菌活性，主要對痢疾桿菌和大腸桿菌引起的腸道感染有效，所以會把黃連素用在消化道感染的治療中，但其本身并不是抗生素。
一般抗生素指從微生物中提取出來的，對細菌具有作用的物質(zhì)，而黃連素是從中藥內(nèi)提取出來的中藥成分，具有一定的抑菌活性，所以在感染性疾病中可以使用，但是從分類上不能把其分為抗生素。