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兩性畸形原因較多見，最常見染色體、基因異常，造成最終患兒生出后出現(xiàn)兩性畸形的狀態(tài)，具體如下：

1、基因突變：兩性畸形患者中60%可查出存在基因異常，而基因異?？赡苓z傳自父親、母親。也可能在在精子卵子相結(jié)合成受精卵后發(fā)生一些基因突變，或者精子和卵子受精前就已經(jīng)發(fā)生基因突變，最終導(dǎo)致胎兒基因問題；

2、染色體異常：也是在精子、卵子結(jié)合前或結(jié)合后產(chǎn)生染色體變異，嵌合體也屬于染色體異常，可能在同一個體中出現(xiàn)兩種或兩種以上的染色體狀態(tài)，最終也會導(dǎo)致兩性畸形，即需從遺傳學(xué)角度找原因；

3、基因或染色體都不能找到明確原因，但在母體懷孕期間胎兒接觸不良環(huán)境造成，包括懷孕早期使用保胎藥物，或接觸到塑化劑也就是塑料制品，或者受到射線，或者母體自身疾病造成激素改變；

4、部分兩性畸形可能無法找到明確原因，單純表現(xiàn)為兩性畸形的外觀。