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間質(zhì)瘤嚴重程度跟發(fā)病部位關(guān)系不大。間質(zhì)瘤可以發(fā)生于胃任何部位，可以在賁門部、在胃底、胃體、以及在幽門部發(fā)生。而間質(zhì)瘤的嚴重程度主要取決于發(fā)生的早晚。這里面有一些指標，如腫瘤的大小、核分裂象；在病理學(xué)上可分為低危、中危和高危。
低危往往通過手術(shù)切除以后，并不需要進一步的治療；但是中危和高危的間質(zhì)瘤切除以后，往往需要病人長期服用伊馬替尼等靶向藥物