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碳13是碳14的改良版，碳13的準確性更高，碳13的準確性達到99%，是國際公認的金標準，而碳14的準確率在70%左右，并且碳13無放射性，碳14有長期的放射性。
碳13呼氣試驗是最新的快速并且無輻射的檢測技術，不需要胃鏡，只要輕松呼氣，測定呼氣成分即可，患者配合度更高，治療后復檢無心理負擔，也為臨床醫(yī)生提供了更好的參考依據。另外，碳13更適合于老年人、兒童、孕婦等使用，因為其沒有放射性，臨床應用范圍更加廣泛。
碳14也是呼氣試驗，但它是放射性同位素，會產生β射線，這是一種可以造成離子化的射線，是人類日常生活中接觸到的具有致癌性的因子。所以雖然兩者的準確性差別不是特別大，但是目前臨床的檢查更傾向于進行碳13檢查。