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大腦發(fā)育遲緩多與遺傳因素有關，80%-90%的大腦發(fā)育遲緩兒童屬于家族性體質性發(fā)育延遲。這種情況會出現(xiàn)生長激素缺乏或者是甲狀腺素缺乏、染色體異常、代謝性疾病而導致身材矮小，腦容量不能夠正常發(fā)展。
而胎兒在母體內的腦部生長發(fā)育受到生長環(huán)境、營養(yǎng)情況因素影響。如果孕母在妊娠早期患有影響胎兒的疾病，可以導致胎兒出現(xiàn)生長發(fā)育畸形的情況。
兒童腦部損傷或者是神經(jīng)損傷，有可能導致中樞神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育遲緩，甚至發(fā)育不全。在更多的情況下，可能找不到明確的醫(yī)學原因，解釋腦部生長發(fā)育遲緩的問題。