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磁共振與CT同屬于醫(yī)學影像學范疇，但是二者存在著本質的差異。
首先，工作原理不同，磁共振是利用人體內氫原子核在磁共振的儀器強大的磁場空間內，產生共振與還原的過程中釋放出能量信息，再通過高能電子計算機系統(tǒng)采集信號，經過數字重建技術轉換成磁共振圖像；CT是利用X線成像原理，形成圖像。
其次，二者檢查的側重范圍不一樣，磁共振對軟組織，如滑膜、血管、神經、肌肉、肌腱、韌帶和透明軟骨的分辨率高，CT再觀察骨頭、肺、出血等方面比較有優(yōu)勢，二者在檢查上可以優(yōu)勢互補，如果長時間做CT，對人體是有一定輻射的，而磁共振是沒有輻射的。