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新生兒高膽紅素的病因，按照高的結合膽紅素血癥和高的未結合膽紅素血癥來分，可以分為如下：
1、高結合膽紅素血癥，也就是直接膽紅素增高的，有新生兒宮內感染，如巨細胞病毒感染、新生兒梅毒、膽道閉鎖、新生兒肝炎、各種原因導致的新生兒膽汁粘稠綜合征、膽總管囊腫及半乳糖血癥等；
2、已高的未結合膽紅素增高的，常見的有ABO溶血病、Rh溶血病、紅細胞膜形態(tài)的異常，如球形紅細胞增多癥、橢圓形的紅細胞增多癥、血紅蛋白病、新生兒出血、胎糞排出延遲、母乳性的黃疸、甲狀腺功能低下、紅細胞增多癥或者是早產兒等。