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百日咳是根據(jù)典型的臨床經(jīng)合期的表現(xiàn)，和實(shí)驗(yàn)室檢查可以查出來的。經(jīng)合期的表現(xiàn)為陣發(fā)痙攣性的咳嗽，咳嗽發(fā)生一種特殊的高音調(diào)，雞啼樣吸氣性吼聲，俗稱回勾，然后又發(fā)生一次痙咳，反復(fù)多次，直至咳出大量黏稠痰液，同時(shí)伴有嘔吐、眼瞼浮腫、球結(jié)膜出血，及舌系帶潰瘍等癥狀，一般持續(xù)2-6周，可長(zhǎng)達(dá)兩個(gè)月以上，實(shí)驗(yàn)室的檢查分為以下幾種：
第一、血常規(guī)，早期外周血白細(xì)胞計(jì)數(shù)升高，經(jīng)合期最為明顯，常為（20-50）×10^9/L，其中以淋巴細(xì)胞為主，一般大約60%，亦可高達(dá)90%。
第二、細(xì)菌型的檢查，其中包括：1、細(xì)菌培養(yǎng)，發(fā)病第一周可高達(dá)90%左右，以后逐漸降低，直至四周陽性率僅為2%。2、單克隆抗體菌落印跡試驗(yàn)，此方法快捷，48小時(shí)可出結(jié)果，敏感性較高可用于早期診斷。3、熒光抗體法，早期陽性率達(dá)75%-85%，可協(xié)助診斷，但要注意有假陽性。
第三、血清學(xué)檢查，主要是采兩份血清，急性期和恢復(fù)期。主要用于回顧性診斷和不典型病例的輔助診斷，酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)，可以測(cè)定百日咳特異性，IgM、IgG、IgA抗體，作為早期診斷的依據(jù)，對(duì)細(xì)均培養(yǎng)陰性者更有意義。
第四、分子生物學(xué)檢測(cè)，用PCR檢查患者鼻咽分泌物，百日咳桿菌DNA具有快速敏感特異性的診斷價(jià)值。
第五、嘌呤環(huán)化酶活性檢測(cè)，此方法最大的優(yōu)點(diǎn)是快捷且陽性率高，用于早期診斷有較大的前途。