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雖然百日咳是計劃免疫，大部分人可能都對它有一定抵抗力，但依然有散在百日咳發(fā)病的情況。癥狀比較有特點的就是陣發(fā)性痙攣性咳嗽，同時伴有雞鳴一樣吸氣性的吼聲，病程比較長，可能會持續(xù)幾個月，所以叫百日咳，也可能會出現(xiàn)并發(fā)肺炎相應的疾病。因為是傳染病，早期有潛伏期一般是7-14天，也有21天的，然后出現(xiàn)典型的百日咳的癥狀。
可以把病程分成三個階段，第一個卡他期，就是剛感染的時候類似于普通的感冒，是輕微的咳嗽、鼻塞、流涕、低熱、咽喉疼痛，但是這個階段已經有傳染性了。第二個是如果到急性發(fā)作期的時候，就是有癥狀的時候，就叫攣咳期，就是痙攣性的咳嗽，一般有的時候持續(xù)2-6周或者是兩個月以上。第三個是后面出現(xiàn)恢復期，就是咳嗽的程度和頻率逐漸的減輕，進入恢復階段。