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1、X線檢查：X線檢查是本病診斷的主要依據(jù)，根據(jù)先天性短結(jié)腸患兒的臀部倒立位平片、腹部X平片的液平面寬度來進(jìn)行診斷。
2、鋇劑灌腸檢查：為輔助醫(yī)生了解結(jié)腸和直腸的情況，直腸、肛門畸形存在瘺的患兒，術(shù)前應(yīng)做鋇劑灌腸檢查。
3、B超檢查：通過B超檢查可診斷腸道是否并發(fā)腸瘺，以及腸瘺的具體程度，明確是否伴發(fā)其他腸道畸形。