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診斷亞急性甲狀腺炎可以根據(jù)病史、癥狀、體征，以及實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果來確定診斷，診斷并不困難，但是不典型病例經(jīng)常容易被誤診，可以從以下幾個方面進(jìn)行診斷：
第一、甲狀腺功能，亞急性甲狀腺炎的分期不同，實(shí)驗(yàn)室結(jié)果也各不相同，急性期的時候血清T3、T4升高，TSH降低，碘-131的攝取率減低，主要是甲狀腺炎癥損傷，甲狀腺濾泡內(nèi)儲存的T3、T4大量釋放入血，通過下丘-腦垂體-甲狀腺軸的負(fù)反饋調(diào)節(jié)作用使TSH反射性地減少。同時，炎癥損傷也使甲狀腺細(xì)胞對碘的攝取率降低，血沉加快，白細(xì)胞升高，甲狀腺抗體呢通常情況下陰性。在甲狀腺功能減退期，血中的T3、T4逐漸降至正?；虻陀谡Ｋ剑琓SH逐漸回升至正常，碘-131的攝取率逐漸恢復(fù)正常。
第二、攝碘率及甲狀腺核素顯像，雖然甲狀腺功能亢進(jìn)，但是攝碘率很低，被稱為分離現(xiàn)象，是亞急性甲狀腺炎的特異性表現(xiàn)，對于診斷具有決定性價值，ECT的結(jié)果可以見到甲狀腺內(nèi)的熒光減少。
第三、甲狀腺超聲檢查，可以見到規(guī)則的低回聲區(qū)，甲狀腺的不均質(zhì)改變或者甲狀腺的一個粗糙。
第四、甲狀腺的細(xì)針抽吸細(xì)胞學(xué)檢查，甲狀腺濾泡細(xì)胞破壞為主，可以見到分葉的細(xì)胞、單核細(xì)胞、多核巨噬細(xì)胞浸潤，還有微膿腫的形成和纖維化。雖然這種方法診斷亞急性甲狀腺炎是一個金標(biāo)準(zhǔn)，但是是一個有創(chuàng)的檢查，不容易被患者接受，所以這種方法沒有被納入診斷本病的一個常規(guī)檢查。當(dāng)診斷困難或懷疑合并其他甲狀腺疾病時，甲狀腺細(xì)針抽吸細(xì)胞學(xué)檢查才被納入考慮的范圍之內(nèi)。