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有多種支原體和多種衣原體可以引起人類感染，但感染部位不同，所引起的疾病也有所差別，大致如下：
1、呼吸道感染：如肺炎支原體和肺炎衣原體，可以通過(guò)呼吸道飛沫傳播，屬于急性呼吸道的傳染病，患者可以表現(xiàn)為發(fā)燒伴有干咳，通常表現(xiàn)為刺激性干咳，一般可以通過(guò)衣原體、支原體抗體、胸部CT檢查進(jìn)行明確診斷。
2、泌尿生殖道感染：則屬于性傳播疾病，主要傳播途徑是通過(guò)性接觸傳播，引起泌尿生殖道感染的支原體，常見(jiàn)為解脲支原體或人型支原體。引起泌尿生殖道感染的衣原體，常見(jiàn)的是沙眼衣原體。如果治療不徹底，容易引起病情反復(fù)發(fā)作，所以對(duì)泌尿生殖道的支原體感染，治療療程通常要比呼吸道支原體感染療程要長(zhǎng)，否則容易引起復(fù)發(fā)。