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腦囊蟲病的確診方法需綜合流行病學、臨床表現(xiàn)及實驗室檢查等多種方法，對于曾居住在流行病區(qū)，有絳蟲史或者使用生豬肉史的患者，同時合并有癲癇、顱內壓升高、精神障礙等臨床表現(xiàn)時應給予臨床懷疑診斷。
如果有皮下結節(jié)或糞便中發(fā)現(xiàn)蟲卵，可提示診斷，血清或腦脊液囊蟲抗體試驗陽性、頭顱CT或磁共振有特征性的改變則能確定診斷。
在診斷的同時需和其他一些疾病相鑒別，如與腦腫瘤、蛛網膜囊腫、各種腦膜炎相鑒別。