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乙肝小三陽感染者無論是自然轉(zhuǎn)陰，還是抗病毒治療后轉(zhuǎn)陰，都有很大可能會復發(fā)。乙肝小三陽自然轉(zhuǎn)陰比例將近是乙肝大三陽的50倍，但每年小三陽自然轉(zhuǎn)陰率也僅為0.5%-1%，即使轉(zhuǎn)陰后十年，也會有14%轉(zhuǎn)陰人群肝細胞中仍然會檢測出乙肝病毒cccDNA，肝細胞中的乙肝病毒cccDNA就是乙肝病毒復制的模板，會造成乙肝病毒復發(fā)。
乙肝小三陽經(jīng)抗病毒治療后也會轉(zhuǎn)陰，當乙肝表面抗原＜1500IU/L時，應用長效干擾素抗病毒治療是所有抗病毒療法中轉(zhuǎn)陰率最高的一種，停藥三年后也只僅有11%才會轉(zhuǎn)陰。雖然表面抗原轉(zhuǎn)陰了，但如果沒有出現(xiàn)表面抗體陽轉(zhuǎn)，復發(fā)的可能性也會達到50%以上。其他口服抗病毒療法的轉(zhuǎn)陰率更低，最近上市的口服抗病毒藥物富馬酸丙酚替諾福韋片小三陽轉(zhuǎn)陰率1%，和小三陽的自然轉(zhuǎn)陰率幾乎相同。所以，乙肝小三陽要想通過抗病毒治療后轉(zhuǎn)陰，可能性微乎其微。