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病毒性肺炎的病因最主要是病毒的感染，比較常見的上呼吸道的病毒，像流感病毒主要包括甲型和乙型病毒，還有副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒，以及冠狀病毒、巨細胞病毒。也包括水痘-帶狀皰疹病毒，還有一些腸道的病毒，如柯薩奇病毒、埃可病毒。2003年的非典型肺炎也是由冠狀病毒感染引起的，因此病毒性肺炎需引起廣泛重視。