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骨結核發(fā)病過程分為兩種：

1、原發(fā)灶結核分枝桿菌通過血或淋巴途徑形成大量結核分枝桿菌栓子，栓子隨血液循環(huán)至全身組織，在正常機體免疫力作用下多數(shù)微小病灶被清除，少數(shù)未被清除的結核分枝桿菌栓子，停留在血流緩慢的微小終末動脈處，進行局部繁殖并形成微小靜止病灶，機體免疫力下降后，靜止病灶重新活躍引起局部癥狀；

2、少數(shù)患者存在原發(fā)于淋巴結、胸膜等部位的病變，結核性膿腫直接蔓延到骨與關節(jié)，導致骨結核發(fā)生。

骨結核是一種由T細胞所介導的遲發(fā)性超敏反應。結核分枝桿菌入侵人體后在一定條件下，巨噬細胞將含有結核分枝桿菌的吞噬體傳遞至溶酶體，借助溶酶體的多種酶對其殺傷，一系列的機制使吞噬細胞提高自身凋亡水平對病原菌進行清除，同時通過抗原呈遞細胞進一步增強巨噬細胞功能。

決定感染最終結果的關鍵是結核分枝桿菌與宿主免疫系統(tǒng)的相互作用水平，存在以下三種結果，包括結核分枝桿菌被免疫應答殺滅、10%宿主在一定時間內(nèi)發(fā)展成為活動型肺結核和其它結核病、90%宿主成為潛伏感染者。影響相互作用的因素包括結核分枝桿菌菌量、細菌毒力和宿主免疫力、局部解剖結構以及免疫抑制劑使用不當。