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自身免疫性腦炎根據(jù)疾病輕重程度不同，患者死亡率各異，如NMDA腦炎死亡率和致殘率較高，如未盡早識別、診斷，未給予相應(yīng)免疫治療患者預(yù)后相對較差，據(jù)估測死亡率大概在10%-20%，具體死亡率與醫(yī)院救治條件、診療手段、診療水平有關(guān)。

臨床上多數(shù)患者出現(xiàn)呼吸肌麻痹，其與中樞性過度通氣、通氣不足有關(guān)，常面臨氣管插管、機械通氣等情況。同時自身免疫性腦炎存在藥物不敏感，通常預(yù)后較差，死亡率偏高，需要積極護(hù)理。所以患有自身免疫性腦炎應(yīng)到醫(yī)院就診，積極配合醫(yī)生、積極治療，預(yù)后相對較好，但如果錯過最佳治療時機，預(yù)后比較差。