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扁平疣是由人乳頭瘤病毒感染引起的。人乳頭瘤病毒可以通過直接或者間接的接觸而感染，比如皮膚的外傷及破損，對人乳頭瘤病毒感染重要因素，醫(yī)源性感染也是間接接觸感染引起的途徑。扁平疣的發(fā)生與積極的免疫有重要的關(guān)系，在免疫缺陷的狀態(tài)下，比如腎移植的患者，經(jīng)常服用免疫抑制劑，惡性淋巴瘤及白血病的患者免疫功能低下時(shí)，扁平疣的發(fā)病率就明顯增高，尤其是細(xì)胞免疫功能明顯低下的時(shí)候，疣常常發(fā)生，這與積極的全身免疫功能狀態(tài)低下，即免疫耐受有一定的關(guān)系。