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不同細(xì)菌病種的病死率不同，比如毒力較強(qiáng)的耐甲氧西林葡萄球菌引起的化膿性細(xì)菌性腦膜炎，死亡率可達(dá)20%-30%。對(duì)于其它社區(qū)獲得性腦膜炎，如肺炎鏈球菌性腦膜炎經(jīng)過(guò)早期治療后，治愈率達(dá)90%以上，但是此類(lèi)患者起病均較急，如果早期未獲得積極治療，一般會(huì)威脅生命，導(dǎo)致患者死亡。

院內(nèi)發(fā)生的細(xì)菌性腦膜炎，如葡萄球菌性腦膜炎，以及多重耐藥的鮑曼不動(dòng)桿菌、肺炎克雷伯桿菌引起的腦膜炎，因耐藥導(dǎo)致顱內(nèi)感染的死亡率都比較高，到目前為止認(rèn)為多重耐藥細(xì)菌，尤其是耐碳青霉烯的肺炎克雷伯桿菌引起的腦膜炎，死亡率接近100%。