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通常臨床開具的都是大便的普通培養(yǎng)，即常規(guī)培養(yǎng)，主要用來檢出疫區(qū)、社區(qū)的感染性腹瀉、沙門氏菌、志賀氏菌，即常說的痢疾桿菌。

另外，住院超過三天，有抗生素使用史的腹瀉患者，不能進行普通的大便培養(yǎng)，因為普通大便培養(yǎng)只在需氧環(huán)境下，抗生素相關(guān)性腹瀉主要由難辨梭菌引起，難辨梭菌是厭氧菌，普通大便培養(yǎng)時可漏檢，應(yīng)進行難辨梭菌的培養(yǎng)。如果不具備難辨梭菌培養(yǎng)的厭氧環(huán)境，要對大便進行難辨梭菌毒素的檢查，判斷是否為抗生素相關(guān)性腹瀉，即偽膜性腸炎引起的腹瀉。