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自閉癥主要是遺傳因素引起的，同時也有一定的環(huán)境因素作為影響因素。但是自閉癥作為兒童期比較嚴重的精神疾病，最主要的原因是遺傳因素引起的，比如有可能伴隨著多基因遺傳問題或者是基因突變問題。

從統(tǒng)計學(xué)角度，如果家庭中尤其是三代以內(nèi)的直系親屬有自閉癥、焦慮癥的問題，或者是三代以內(nèi)的旁系親屬有自閉癥的問題，患兒出現(xiàn)自閉癥的概率大大增加，可能是普通人的幾倍到十幾倍，從這個角度自閉癥由于遺傳因素引起來的可能性很大。